自从1973 年国际自然和自然资源保护组织将扬子鳄列人濒危动植物国际贸易公约附录Ⅰ的名单以来，扬子鳄便成为国际共同保护的动物。
我国于1979 年12 月1 日，由国家林业部和安徽省联合在宣州市扬子鳄产地建立了扬子鳄养殖场。并于1980 年9 月也将扬子鳄列为国家I 级保护动物，受法律保护。由于扬子鳄分布区多是人口稠密的经济活动区，很多问题无法解决。比如说人多地少，不可能留出荒地供扬子鳄栖息，居民要烧柴就到处砍伐木材，这样扬子鳄缺少营巢所用的杂草等，难以繁殖后代。另外，新的农业技术还没有取代现有的种植方法，化肥、农药仍然在使用，这样扬子鳄的天然饵料不可能再恢复到未使用农药前的那样丰富。因此，种群恢复在相当长时间内是不可能的。
我国林业部和安徽省人民政府在安徽省宣州市建立了"安徽省扬子鳄繁殖研究中心"，专门从事扬子鳄的人工饲养和繁殖的研究工作。多年来，繁殖研究中心做了大量研究工作，先后解决了成鳄的人工饲养、在人工饲养条件下成鳄繁殖、卵在人工条件下孵化、幼鳄在人工条件下生长等理论及技术问题，并开始进行大规模的人工饲养和繁殖工作。饲养区内设有成鳄繁殖区、分龄饲养区、人工孵化室及幼鳄饲养室等，于1982 年首次孵出幼鳄147 条，以后繁殖的数量逐年增加。目前研究中心已拥有较熟练的研究人员、技术人员及饲养人员，已成为保存扬子鳄种群可靠的基地。多年来，先后孵化出幼鳄近万条。
1982 年我国政府又在宣州、南陵、泾县、郎溪、广德五市、县划定433 千米2 的扬子鳄保护区，各市、县成立了相应的保护机构，并组织了一支保护扬子鳄的专业队伍，专门负责保护野生扬子鳄的工作。
与此同时，各地的饲养繁殖工作也相继展开。如1976 年安徽师范大学生物系采集一窝野生的扬子鳄卵进行人工孵化，孵化出幼鳄16 条。1979 年上海动物园人工饲养成年扬子鳄产卵，并在人工孵化条件下孵出幼鳄。随后在宁波动物园及浙江省安吉县人工饲养的成年扬子鳄也产卵并孵出幼鳄。所有这些工作都使得扬子鳄的种群很快得以恢复和扩大人工繁育的成功使这一珍稀动物跨越了濒危生死线，而且正在被人们认识和利用。这样，在1992 年便将扬子鳄列为国家Ⅱ级保护动物。
1992 年在东京召开的国际濒危动植物贸易与保护公约( CITES )缔约国大会，已允许安徽省扬子鳄繁育中心限制性商业出口人工饲养的扬子鳄仔二代及产品，但扬子鳄产品在我国尚未开发成功，使得它潜在的商业利用价值偏低。根据《 野生动植物濒危物种国际公约》 ，当前能进行国际贸易的鳄类共有12 种，分别是：扬子鳄、密河鳄、凯门鳄（包括3 个亚种）、宽吻凯门鳄、巴拉圭眼镜鳄、澳大利亚鳄、尼罗鳄、湾鳄、新几内亚鳄、黑鳄、滑额古鳄、侏古鳄，尽管上述鳄类能进行国际贸易，但仍要受到一定的限制。
据统计，1993 年至今，我国共批准从泰国、马来西亚、南非、美国等国进口鳄7 万条。目前，我国的安徽、广东、海南是养鳄数量最大的3 个省份，占全国鳄总存栏量的3 / 4 。我国养殖扬子鳄的已有50 多家，引进养殖外来鳄的有20 多家，总存栏量在10 万条左右。我国鳄的养殖种类主要是泰国鳄和扬子鳄，其次是眼镜鳄、湾鳄、尼罗鳄、密河鳄。